非淋病性的男女患者都可出现并发症,男性常见的有附睾炎、前列腺炎、精囊腺炎等,同性恋患者可出肛门瘙痒和直肠炎。
女性患者较常见的有前庭大腺炎、阴道炎、子宫颈炎、输卵管炎,病原体又可由于子宫扩散到腹腔,引起腹膜炎或肝周围炎。这些病人往往出现反复炎症并可造成不育症。